黔北麻羊TYR基因多态性及生物信息学分析

作者: 翁吉梅罗铮徐伟封竣琪黄兰蔡惠芬罗卫星

关键词: 黔北麻羊 TYR基因 SNPs 生物信息学

摘要：为研究黔北麻羊毛色形成的遗传机制,本实验对黔北麻羊哺乳动物酪氨酸酶(TYR)基因外显子区域运用混合DNA池结合PCR产物直接测序方法进行多态性分析,在TYR基因外显子区域共筛选出5个SNPs,分别为Exon1-G617A、Exon1-G685T、Exon3-C 1236T (Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)、Exon5-T1862C;进而利用生物信息学分析软件对PCR扩增所获序列进行mRNA二级结构及蛋白质二级结构和三级结构分析,发现Exon3-C 1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)引起mRNA二级结构的改变,其中Exon 1-G685T、Exon3-C1236T (Asn-Lys)、Exon5-T1862C突变导致其mRNA二级结构最小自由能增大,即二级结构稳定性降低,其错义突变位点Exon3-C 1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)均引起蛋白质二级结构和三级结构的改变.

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黔北麻羊TYR基因多态性及生物信息学分析

作者: 翁吉梅 罗铮 徐伟 封竣琪 黄兰 蔡惠芬 罗卫星

关键词: 黔北麻羊 TYR基因 SNPs 生物信息学

作者: 翁吉梅罗铮徐伟封竣琪黄兰蔡惠芬罗卫星