绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析

作者:宋旭婷翟羽飞张嘉楠亓美玉王志鹏付晶姚玉昌

关键词: 绵羊; IGF-Ⅰ基因; 变异剪接体; 生物信息学分析; 组织表达;

摘要：为明确绵羊IGF-Ⅰ基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ基因Ⅱ类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律。结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点。组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显著高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型表达水平显著高于成羊期(P<0.05)。总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型。

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绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析

作者:宋旭婷 翟羽飞 张嘉楠 亓美玉 王志鹏 付晶 姚玉昌

关键词: 绵羊; IGF-Ⅰ基因; 变异剪接体; 生物信息学分析; 组织表达;

作者:宋旭婷翟羽飞张嘉楠亓美玉王志鹏付晶姚玉昌